בבג"צ 10934/02 קיבוץ כפר עזה אגודה להתיישבות חקלאית שיתופית נ' מינהל מקרקעי ישראל, , נדונה שאלת חוקיותן של הוראות המעבר שנתקבלו ביום 2.9.03. בין היתר, נקבע שם כי: "אכן, יתכנו מיקרים בהם יסתבר שהוראות המעבר אינן נותנות מענה סביר וראוי לנסיבות המתעוררות לגבי עסקה מסוימת. ההוראות מנוסחות באופן כללי, ונותנות מסגרת והנחיות אשר על פיהן יש להכריע ביחס לכל העסקאות. אך מטבע הדברים, יתכנו מקרים חריגים שקביעות כלליות במסגרת הוראות מעבר לא תתנה להם תשובה ברורה, ואף יתכנו מקרים מיוחדים, קיצוניים, אשר יצדיקו סטיה מן ההוראות. כך, למשל, יתכן שאי עמידתה של עסקה מסוימת במועדים הנקובים בהוראות המעבר להשלמתה, תהא תוצאה של עיכוב והתמשכות ההליכים מנימוקים התלויים במינהל עצמו. נסיבות כאלה תצדקנה, ולעיתים אף תחייבנה, בדיקה מחודשת של המשך תחולת הוראות המעבר, על העסקה הנדונה, אף אם חלפו המועדים הנקובים בהוראות המעבר" (סעיף 31 לפסק הדין). על פי פסק הדין הנ"ל ישנה אפשרות, על פי שיקול הדעת המנהלי, לסטות מהוראות המעבר הכלליות, במקרים מתאימים. תקיפתה של החלטה, שלא לנהוג כלפי המשיב באופן חריג, בהתאם לשיקול הדעת הנתון למנהל כמפורט לעיל, הינה בבירור סוגיה מן התחום המנהלי. כך, בבג"צ 9910/04 בית יצחק שער חפר אגודה להתיישבות חקלאית בע"מ נ' מינהל מקרקעי ישראל, נדונה טענת העותר כנגד החלטת המנהל שלא להחיל עליו את החלטה 727, כאשר השאלה שהועלתה שם הייתה האם היה על המנהל לנהוג באותו מקרה באופן חריג להוראות המעבר עקב הנסיבות הכרוכות באישור התוכנית. קרקעותמינהל מקרקעי ישראל